MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid B

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007411	ATTTA	2	10	960	969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007411	AAT	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007411	ATT	2	6	2899	2904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007411	TAA	2	6	2922	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007411	TGT	2	6	3561	3566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007411	ATT	2	6	3678	3683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007411	TCA	2	6	5124	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007411	TTA	2	6	7378	7383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007411	AAT	2	6	9788	9793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007411	ATTT	2	8	9848	9855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007411	TTG	2	6	9860	9865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007411	CTC	2	6	17021	17026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007411	A	6	6	17838	17843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007411	AAGA	2	8	17851	17858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007411	TAA	2	6	17895	17900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007411	T	7	7	17967	17973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007411	T	6	6	17985	17990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007411	A	6	6	17991	17996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007411	AT	4	8	18002	18009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007411	CTT	2	6	18132	18137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007411	TAG	2	6	18188	18193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007411	GAA	2	6	18199	18204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007411	AAG	2	6	18221	18226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007411	CTT	2	6	18237	18242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007411	AGA	2	6	18313	18318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007411	AGG	2	6	18378	18383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007411	AGAA	2	8	18438	18445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007411	ATAC	2	8	18456	18463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007411	AACC	2	8	18520	18527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007411	ACG	2	6	18540	18545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007411	CCA	2	6	18552	18557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007411	T	6	6	18600	18605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007411	TAC	2	6	19020	19025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007411	TTA	2	6	19027	19032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007411	ACTA	2	8	19616	19623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007411	T	7	7	19624	19630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007411	ATT	2	6	19674	19679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007411	CAT	2	6	19680	19685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007411	CTCATA	2	12	19697	19708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007411	TTGT	2	8	19764	19771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007411	ATC	2	6	19796	19801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007411	AG	3	6	19852	19857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007411	CTA	2	6	19874	19879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007411	ATTT	2	8	19902	19909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007411	CTC	2	6	19910	19915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007411	AGTA	2	8	20002	20009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007411	GGTG	2	8	20010	20017	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007411	AATT	2	8	20019	20026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007411	AAG	2	6	20087	20092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007411	AGT	2	6	20173	20178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007411	CGT	2	6	20232	20237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007411	GTT	2	6	20270	20275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007411	TCT	2	6	20281	20286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007411	CT	3	6	20290	20295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007411	TTC	2	6	21742	21747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007411	ATTT	2	8	21761	21768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007411	CGA	2	6	21805	21810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007411	AATT	2	8	21873	21880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007411	T	9	9	21909	21917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007411	ACA	2	6	23744	23749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007411	TGTT	2	8	23891	23898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007411	TCT	2	6	23936	23941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007411	TCC	2	6	23973	23978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007411	TCCC	2	8	23996	24003	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_007411	GTA	2	6	24100	24105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007411	TTG	2	6	24111	24116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007411	TGG	2	6	24135	24140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007411	TCT	2	6	24170	24175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007411	TCA	2	6	24194	24199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007411	TTG	2	6	24213	24218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007411	A	6	6	24221	24226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007411	A	6	6	25407	25412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007411	TTA	2	6	25424	25429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007411	T	6	6	25469	25474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007411	TTAC	2	8	25476	25483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007411	ATT	2	6	25588	25593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007411	CAG	2	6	25604	25609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007411	GTT	2	6	25630	25635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007411	TTGC	2	8	27886	27893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007411	TTTG	2	8	27917	27924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007411	CAA	2	6	28505	28510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007411	TTA	2	6	28658	28663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007411	GCA	2	6	28688	28693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007411	A	7	7	31127	31133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007411	AGTA	2	8	31151	31158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007411	AGGT	2	8	31176	31183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007411	TGA	2	6	31231	31236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007411	GCA	2	6	31253	31258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007411	ACA	2	6	31845	31850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007411	ATA	2	6	31973	31978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007411	TG	3	6	33160	33165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007411	CTG	2	6	33195	33200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007411	AAT	2	6	33269	33274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007411	TG	3	6	33308	33313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007411	TAAA	2	8	33398	33405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007411	TA	3	6	33492	33497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007411	AC	3	6	33530	33535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007411	ACC	2	6	33561	33566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007411	TTG	2	6	33570	33575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007411	A	8	8	33589	33596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007411	AAG	2	6	33609	33614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.